南京農(nóng)業(yè)大學金融學院的發(fā)展歷史可上溯至20世紀初期。1921年秋，金陵大學設(shè)立我國第一個農(nóng)業(yè)經(jīng)濟學系，卜凱教授開始從事農(nóng)業(yè)保險方面的調(diào)查研究。1929年秋，中央大學農(nóng)學院設(shè)立農(nóng)政科，開設(shè)農(nóng)村金融等課程。1952年，金陵大學農(nóng)學院、南京大學農(nóng)學院和浙江大學農(nóng)學院部分系科合并成立南京農(nóng)學院，下設(shè)農(nóng)業(yè)經(jīng)濟系等。1984年，南京農(nóng)學院更名為南京農(nóng)業(yè)大學，農(nóng)業(yè)經(jīng)濟系增設(shè)農(nóng)村金融專業(yè)，同年開始招收農(nóng)村金融和會計審計方向碩士研究生，1985年開始招收金融專業(yè)本科生，1998年取得金融學碩士學位授予權(quán)，2002年開始招收農(nóng)村金融專業(yè)博士生，2004年取得會計學碩士學位授予權(quán)，2010年獲金融學博士學位授權(quán)點。2012年10月，成立南京農(nóng)業(yè)大學金融學院。

金融學院現(xiàn)有金融學、會計學和投資學三個本科專業(yè)。其中2006年金融學專業(yè)列為江蘇省品牌專業(yè)，2010年會計學專業(yè)列為江蘇省特色專業(yè)，2012年金融學專業(yè)和會計學專業(yè)又成為江蘇省重點建設(shè)專業(yè)。

金融學院目前擁有金融學博士、金融學碩士、會計學碩士、金融碩士(MF)、會計碩士(MPAcc)等多層次的研究生培養(yǎng)體系，為中國農(nóng)業(yè)銀行總行、中國人民銀行南京分行等舉辦金融學碩士班，為政府有關(guān)部門、銀行、保險公司、證券公司、會計審計事務(wù)所等培養(yǎng)了眾多高層次的金融、會計和審計方面的專業(yè)人才。

金融學院現(xiàn)有專職教師及研究人員40多名，其中教授10人，副教授11人，博導7人，碩導23人，具有博士學位教師占90.3%，擁有海外學習經(jīng)歷教師占32.2%，江蘇省“青藍工程”中青年學術(shù)帶頭人1人，江蘇省“青藍工程”優(yōu)秀青年骨干教師1人，南京農(nóng)業(yè)大學“鐘山學術(shù)新秀”培養(yǎng)對象3人。具有較高的教學水平和研究能力。學院目前共有重點共建基地14家，包括民生銀行、江蘇銀行、紫金農(nóng)商銀行、淮安農(nóng)商銀行、蘇寧集團、畢馬威會計師事務(wù)所等。

金融學院教師依托江蘇省高校哲學社會重點研究基地——江蘇省農(nóng)村金融發(fā)展研究中心、南京農(nóng)業(yè)大學中國金融和區(qū)域經(jīng)濟研究中心、南京農(nóng)業(yè)大學財政金融研究所等研究平臺開展研究工作。近幾年來，本院教師主持國家社科基金重大項目、國家社科基金重點項目、國家自然科學基金、國家社科基金一般項目、教育部、農(nóng)業(yè)部、世界銀行等各種省部級以上課題90多項，在《世界經(jīng)濟與政治》、《管理世界》、《金融研究》、《會計研究》及國外高水平專業(yè)期刊上發(fā)表研究論文300余篇，獲得省部級等各種獎勵30多項。