李百藥，字重規(guī)，定州安平人，隋內(nèi)史令、安平公德林子也。為童兒時(shí)多疾病，祖母趙氏故以百藥為名。七歲解屬文。父友齊中書(shū)舍人陸乂、馬元熙嘗造德林宴集，有讀徐陵文者，云“既取成周之禾，將刈瑯邪之稻”，并不知其事。百藥時(shí)侍立，進(jìn)曰：“《傳》稱‘鄅人藉稻’。杜預(yù)《注》云‘鄅國(guó)在瑯邪開(kāi)陽(yáng)’。”乂等大驚異之。

開(kāi)皇初，授東宮通事舍人，遷太子舍人，兼東宮學(xué)士。或嫉其才而毀之者，乃謝病免去。十九年，追赴仁壽宮，令襲父爵。左仆射楊素、吏部尚書(shū)牛弘雅愛(ài)其才，奏授禮部員外郎，皇太子勇又召為東宮學(xué)士。詔令修五禮，定律令，撰陰陽(yáng)書(shū)。臺(tái)內(nèi)奏議文表，多百藥所撰。時(shí)煬帝出鎮(zhèn)揚(yáng)州，嘗召之，百藥辭疾不赴，煬帝大怒，及即位，出為桂州司馬。為沈法興所得，署為掾。其后，罷州置郡，因解職還鄉(xiāng)里。

大業(yè)五年，授魯郡臨泗府步兵校尉。九年，充戍會(huì)稽。尋授建安郡丞，行達(dá)烏程，屬江都難作，復(fù)會(huì)沈法興為李子通所破，子通又命為中書(shū)侍郎、國(guó)子祭酒。及杜伏威攻滅子通，又以百藥為行臺(tái)考功郎中?；蛴凶P之者，伏威囚之，百藥著《省躬賦》以致其情，伏威亦知其無(wú)罪，乃令復(fù)職。伏威既據(jù)有江南，高祖遣使招撫，百藥勸伏威入朝，伏威從之，遣其行臺(tái)仆射輔公祏與百藥留守，遂詣京師。

及渡江至歷陽(yáng)，狐疑中悔，將害百藥，乃飲以石灰酒，因大泄痢，而宿病皆除。伏威知百藥不死，乃作書(shū)與公祏令殺百藥，賴伏威養(yǎng)子王雄誕保護(hù)獲免。公祏反，又授百藥吏部侍郎。有譖百藥于高祖，云百藥初說(shuō)杜伏威入朝，又與輔公祏同反。高祖大怒。及公祏平，得伏威與公祏令殺百藥書(shū)，高祖意稍解，遂配流涇州。