支持向量機在 R 語言中的實現(xiàn)和使用
來源:易賢網(wǎng) 閱讀:1246 次 日期:2015-04-02 13:50:43
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支持向量機是一個相對較新和較先進的機器學(xué)習(xí)技術(shù),最初提出是為了解決二類分類問題,現(xiàn)在被廣泛用于解決多類非線性分類問題和回歸問題。繼續(xù)閱讀本文,你將學(xué)習(xí)到支持向量機如何工作,以及如何利用R語言實現(xiàn)支持向量機。

支持向量機如何工作?

簡單介紹下支持向量機是做什么的:

假設(shè)你的數(shù)據(jù)點分為兩類,支持向量機試圖尋找最優(yōu)的一條線(超平面),使得離這條線最近的點與其他類中的點的距離最大。有些時候,一個類的邊界上的點可能越過超平面落在了錯誤的一邊,或者和超平面重合,這種情況下,需要將這些點的權(quán)重降低,以減小它們的重要性。

這種情況下,“支持向量”就是那些落在分離超平面邊緣的數(shù)據(jù)點形成的線。

無法確定分類線(線性超平面)時該怎么辦?

此時可以將數(shù)據(jù)點投影到一個高維空間,在高維空間中它們可能就變得線性可分了。它會將問題作為一個帶約束的最優(yōu)化問題來定義和解決,其目的是為了最大化兩個類的邊界之間的距離。

我的數(shù)據(jù)點多于兩個類時該怎么辦?

此時支持向量機仍將問題看做一個二元分類問題,但這次會有多個支持向量機用來兩兩區(qū)分每一個類,直到所有的類之間都有區(qū)別。

工程實例

讓我們看一下如何使用支持向量機實現(xiàn)二元分類器,使用的數(shù)據(jù)是來自MASS包的cats數(shù)據(jù)集。在本例中你將嘗試使用體重和心臟重量來預(yù)測一只貓的性別。我們拿數(shù)據(jù)集中20%的數(shù)據(jù)點,用于測試模型的準(zhǔn)確性(在其余的80%的數(shù)據(jù)上建立模型)。

# Setup

library(e1071)

data(cats, package="MASS")

inputData <- data.frame(cats[, c (2,3)], response = as.factor(cats$Sex)) # response as factor

線性支持向量機

傳遞給函數(shù)svm()的關(guān)鍵參數(shù)是kernel、cost和gamma。Kernel指的是支持向量機的類型,它可能是線性SVM、多項式SVM、徑向SVM或Sigmoid SVM。Cost是違反約束時的成本函數(shù),gamma是除線性SVM外其余所有SVM都使用的一個參數(shù)。還有一個類型參數(shù),用于指定該模型是用于回歸、分類還是異常檢測。但是這個參數(shù)不需要顯式地設(shè)置,因為支持向量機會基于響應(yīng)變量的類別自動檢測這個參數(shù),響應(yīng)變量的類別可能是一個因子或一個連續(xù)變量。所以對于分類問題,一定要把你的響應(yīng)變量作為一個因子。

# linear SVM

svmfit <- svm(response ~ ., data = inputData, kernel = "linear", cost = 10, scale = FALSE) # linear svm, scaling turned OFF

print(svmfit)

plot(svmfit, inputData)

compareTable <- table (inputData$response, predict(svmfit)) # tabulate

mean(inputData$response != predict(svmfit)) # 19.44% misclassification error

徑向支持向量機

徑向基函數(shù)作為一個受歡迎的內(nèi)核函數(shù),可以通過設(shè)置內(nèi)核參數(shù)作為“radial”來使用。當(dāng)使用一個帶有“radial”的內(nèi)核時,結(jié)果中的超平面就不需要是一個線性的了。通常定義一個彎曲的區(qū)域來界定類別之間的分隔,這也往往導(dǎo)致相同的訓(xùn)練數(shù)據(jù),更高的準(zhǔn)確度。

# radial SVM

svmfit <- svm(response ~ ., data = inputData, kernel = "radial", cost = 10, scale = FALSE) # radial svm, scaling turned OFF

print(svmfit)

plot(svmfit, inputData)

compareTable <- table (inputData$response, predict(svmfit)) # tabulate

mean(inputData$response != predict(svmfit)) # 18.75% misclassification error

尋找最優(yōu)參數(shù)

你可以使用tune.svm()函數(shù),來尋找svm()函數(shù)的最優(yōu)參數(shù)。

### Tuning

# Prepare training and test data

set.seed(100) # for reproducing results

rowIndices <- 1 : nrow(inputData) # prepare row indices

sampleSize <- 0.8 * length(rowIndices) # training sample size

trainingRows <- sample (rowIndices, sampleSize) # random sampling

trainingData <- inputData[trainingRows, ] # training data

testData <- inputData[-trainingRows, ] # test data

tuned <- tune.svm(response ~., data = trainingData, gamma = 10^(-6:-1), cost = 10^(1:2)) # tune

summary (tuned) # to select best gamma and cost

# Parameter tuning of 'svm':

# - sampling method: 10-fold cross validation

#

# - best parameters:

# gamma cost

# 0.001 100

#

# - best performance: 0.26

#

# - Detailed performance results:

# gamma cost error dispersion

# 1 1e-06 10 0.36 0.09660918

# 2 1e-05 10 0.36 0.09660918

# 3 1e-04 10 0.36 0.09660918

# 4 1e-03 10 0.36 0.09660918

# 5 1e-02 10 0.27 0.20027759

# 6 1e-01 10 0.27 0.14944341

# 7 1e-06 100 0.36 0.09660918

# 8 1e-05 100 0.36 0.09660918

# 9 1e-04 100 0.36 0.09660918

# 10 1e-03 100 0.26 0.18378732

# 11 1e-02 100 0.26 0.17763883

# 12 1e-01 100 0.26 0.15055453

結(jié)果證明,當(dāng)cost為100,gamma為0.001時產(chǎn)生最小的錯誤率。利用這些參數(shù)訓(xùn)練徑向支持向量機。

svmfit <- svm (response ~ ., data = trainingData, kernel = "radial", cost = 100, gamma=0.001, scale = FALSE) # radial svm, scaling turned OFF

print(svmfit)

plot(svmfit, trainingData)

compareTable <- table (testData$response, predict(svmfit, testData)) # comparison table

mean(testData$response != predict(svmfit, testData)) # 13.79% misclassification error

F M

F 6 3

M 1 19

網(wǎng)格圖

一個2-色的網(wǎng)格圖,能讓結(jié)果看起來更清楚,它將圖的區(qū)域指定為利用SVM分類器得到的結(jié)果的類別。在下邊的例子中,這樣的網(wǎng)格圖中有很多數(shù)據(jù)點,并且通過數(shù)據(jù)點上的傾斜的方格來標(biāo)記支持向量上的點。很明顯,在這種情況下,有很多越過邊界違反約束的點,但在SVM內(nèi)部它們的權(quán)重都被降低了。

# Grid Plot

n_points_in_grid = 60 # num grid points in a line

x_axis_range &lt;- range (inputData[, 2]) # range of X axis

y_axis_range &lt;- range (inputData[, 1]) # range of Y axis

X_grid_points &lt;- seq (from=x_axis_range[1], to=x_axis_range[2], length=n_points_in_grid) # grid points along x-axis

Y_grid_points &lt;- seq (from=y_axis_range[1], to=y_axis_range[2], length=n_points_in_grid) # grid points along y-axis

all_grid_points &lt;- expand.grid (X_grid_points, Y_grid_points) # generate all grid points

names (all_grid_points) &lt;- c("Hwt", "Bwt") # rename

all_points_predited &lt;- predict(svmfit, all_grid_points) # predict for all points in grid

color_array &lt;- c("red", "blue")[as.numeric(all_points_predited)] # colors for all points based on predictions

plot (all_grid_points, col=color_array, pch=20, cex=0.25) # plot all grid points

points (x=trainingData$Hwt, y=trainingData$Bwt, col=c("red", "blue")[as.numeric(trainingData$response)], pch=19) # plot data points

points (trainingData[svmfit$index, c (2, 1)], pch=5, cex=2) # plot support vectors

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